射频识别中间件主要面临三个方面的安全问题：一是数据传输，射频数据通过网络在各个层次之间传输时，很容易造成安全隐患，如非法入侵者对射频标签进行信息进行拦截、破解和修改，以及依靠非法用户发射干扰线号来堵塞通信线路，导致中间件无法正常接收标签数据。二是身份认证，很多专业的攻击者能够使用中间件获取合法用户的保密数据。同时，攻击者还可以利用假冒标签向阅读器传递信息，使阅读器处理的都是虚假信息。所以，有必要进行身份认证，帮助阅读器鉴别真伪响应信号。三是授权管理，没有经过授权的用户可能尝试使用受保护的中间件服务，因此必须对用户进行安全控制，根据用户的不同要求，将用户的权利制起来。
